var nowColor = -1;
// задержка смены цветов в 1/1000 секундах
var sleepTime = 1500;
// желаемый набор цветов
var sColors = new Array(
"#000000",
"#FFFFFF"
);
// tableColor - id таблицы
setInterval("changeBorderColor(tableColor, sColors)", sleepTime)

function changeBorderColor(objStyle, sColors)
{
nowColor++;
if (nowColor >= sColors.length)
nowColor = 0;
objStyle.style.borderColor = sColors[nowColor];
}